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Gembloux Agro-Bio Tech (GxABT)
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MASTER THESIS
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Genetic analysis of linear classification of Belgian Warmblood foals and mares

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Van Damme, Marie-Astrid ULiège
Promotor(s) : Gengler, Nicolas ULiège ; JANSSENS, Steven
Date of defense : 6-Sep-2019 • Permalink : http://hdl.handle.net/2268.2/7617
Details
Title : Genetic analysis of linear classification of Belgian Warmblood foals and mares
Translated title : [fr] Analyse génétique de la classification linéaire des poulains et juments de sang belge (BWP)
Author : Van Damme, Marie-Astrid ULiège
Date of defense  : 6-Sep-2019
Advisor(s) : Gengler, Nicolas ULiège
JANSSENS, Steven 
Committee's member(s) : Soyeurt, Hélène ULiège
Beckers, Yves ULiège
Everaert, Nadia ULiège
Vanderick, Sylvie ULiège
Language : English
Number of pages : 115
Keywords : [en] linear classification
[en] estimated breeding value
[en] genetic parameters
[en] foals
[en] mares
Discipline(s) : Life sciences > Animal production & animal husbandry
Research unit : Unité génétique animale
Target public : Researchers
Professionals of domain
Student
Institution(s) : Université de Liège, Liège, Belgique
Degree: Master en bioingénieur : sciences agronomiques, à finalité spécialisée
Faculty: Master thesis of the Gembloux Agro-Bio Tech (GxABT)

Abstract

[en] The linear classification to score and evaluate genetically conformation and gait traits was introduced in 2003 in the studbook of the "Belgian Warmblood" horse, the BWP. The purpose of this thesis was to develop a genetic evaluation model estimating conformation and gaits traits, and height at the withers. This genetic evaluation was carried out based on the scores attributed to foals under 1-year-old as well as mares aged 3 to 4-years-old during model and gaits competitions. Observations made on 1,966 mares and 1,612 foals were analysed using a multi-trait animal model. The statistical model included fixed effects for the judge, age and a combination of location and date of evaluation. Using canonical transformation, (co)variance components were computed for mares and foals independently and applied inside the developed genetic evaluation model to generate estimated breeding values (EBV). Approximate genetic correlations were computed from observed correlations between EBV for foal and mare traits as an additional aim of this thesis was to assess if earlier foal traits could be used to predict later mare traits.
Estimates of heritabilities ranged from 0.12 to 0.80 for mares and from 0.08 to 0.34 for foals. The estimated heritability of the height at the withers for mares was 0.54. The estimated genetic correlations ranged from -0.60 to 0.94 for mares and -0.61 to 0.97 for foals, with the majority of traits positively correlated or independent. Standardised EBV based on the average of the genetically evaluated population had close values for mare and stallion populations for all linear conformation traits showing that there were very limited genetic differences between sexes. Moreover, the results of standardised breeding values relative to the total population for mare and stallion populations were close to the mean of the population. According to results from approximate genetic correlations between traits of the mares and foals (based on correlations between EBV), genetic evaluation based on linear traits assessed on foals at an early age could be useful to predict adult performances. This could reduce the generation interval. To conclude, results of this study confirmed that the linear classification system used in the BWP studbook was efficient to score and to evaluate genetically conformation and gaits traits.

[fr] La classification linéaire visant à apprécier et à évaluer génétiquement la conformation et les traits d’allures a été introduite en 2003 au sein du studbook du « Belgian Warmblood », le BWP. Ce mémoire avait pour but de développer un modèle d’évaluation génétique estimant les traits de conformation, d’allures ainsi que la taille au garrot. Cette évaluation génétique a été réalisée sur base des scores attribués aux poulains de moins de 1 an ainsi qu’aux juments âgées de 3 à 4 ans lors de concours de modèles et d’allures. Les observations réalisées sur 1,966 juments et 1,612 poulains ont été analysées à l’aide d’un modèle animal multi-trait. Le modèle statistique contenant des effets fixes pour le juge, l’âge ainsi qu’une combinaison du lieu et de la date de l’évaluation. En utilisant la transformation canonique, les composantes de la (co)variance ont été calculées pour les juments et les poulains, indépendamment, et appliquée au modèle d'évaluation génétique développé pour générer des valeurs d'élevage estimées (EBV). Des corrélations génétiques approximatives ont été calculées à partir des corrélations observées entre les poulains et les caractères des juments afin de savoir si des caractères linéaires évalués précocement sur les poulains pourraient être prédicteur des performances à l’âge adulte.
Les héritabilités estimées variaient de 0.12 à 0.80 pour les juments et de 0.08 à 0.34 pour les poulains. L’héritabilité estimée de la taille au garrot pour les juments est de 0.54. Les corrélations génétiques estimées variaient de -0.60 à 0.94 pour les juments et de -0.61 à 0.97 pour les poulains, la majorité des traits étant corrélés positivement ou indépendants. Les EBV standardisées basées sur la moyenne de la population totale avaient des valeurs proches pour les populations de juments et d'étalons et ce pour l’ensemble des caractères de conformation linéaire. Dès lors, les différences génétiques sont très limitées entre les sexes. En outre, les résultats des valeurs d'élevage standardisées par rapport à la population totale pour les populations de juments et d'étalons étaient proches de la moyenne de la population. Les corrélations génétiques estimées variaient de -0,60 à 0,94 pour les juments et de -0,61 à 0,97 pour les poulains, la majorité des caractères ayant une corrélation positive ou étant indépendant (corrélation de 0). Selon les résultats de corrélations génétiques approximatives entre les caractères des juments et des poulains (basées sur des corrélations entre EBV), une évaluation génétique basée sur des caractères linéaires évalués sur des poulains à un âge précoce pourrait être utile pour prédire les performances chez les adultes. Cela pourrait réduire l'intervalle de génération. En conclusion, les résultats de cette étude ont confirmé que le système de classification linéaire utilisé par le studbook BWP était efficace pour décrire et évaluer génétiquement la conformation et les allures de leurs chevaux.


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Size: 2.33 MB
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Author

  • Van Damme, Marie-Astrid ULiège Université de Liège > Gembloux Agro-Bio Tech

Promotor(s)

Committee's member(s)

  • Soyeurt, Hélène ULiège Université de Liège - ULiège > Agronomie, Bio-ingénierie et Chimie (AgroBioChem) > Modélisation et développement
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  • Beckers, Yves ULiège Université de Liège - ULiège > Agronomie, Bio-ingénierie et Chimie (AgroBioChem) > Ingénierie des productions animales et nutrition
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  • Everaert, Nadia ULiège Université de Liège - ULiège > Agronomie, Bio-ingénierie et Chimie (AgroBioChem) > Ingénierie des productions animales et nutrition
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  • Vanderick, Sylvie ULiège Université de Liège - ULiège > Agronomie, Bio-ingénierie et Chimie (AgroBioChem) > Ingénierie des productions animales et nutrition
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