Utilisation d'outils génomiques pour caractériser la diversité des races de moutons belges concernées par les méthodes agro-environnementales et climatiques : application au mouton laitier belge

Abstract

La Belgique est sujette à un accroissement de l’intérêt porté à l’élevage ovin particulièrement auprès des jeunes agriculteurs, hobbyistes et néo-ruraux. Les races rustiques sont appréciées. Cependant les races locales belges ne sont constituées que de population à faible effectif. Certaines de ces races font d’ailleurs l’objet de primes en Wallonie octroyées par la PAC (MAEC) afin de favoriser leur préservation. C’est le cas des races de moutons Laitier Belge, Entre-Sambre-et-Meuse, Mergelland, Ardennais Tacheté, et Ardennais Roux. Le faible effectif des populations amène à se soucier de leur génétique. En effet, ces races ayant souvent presque disparu, les pools génétiques sont relativement appauvris. La bonne compréhension des outils génomiques (ROH, F, Ne, ..) permet de mettre en évidence les éventuelles faiblesses en termes de diversité génétique de ces populations. L’étude de la diversité du génétique du Laitier Belge permet de mettre en évidence une taille de population efficace actuelle d’environ 55 individus et une consanguinité égale à 0,178, moindre l’East Frisian Brown (F=0,210) mais plus élevé que les autres races étudiées. L’étude de sa proximité avec d’autres races européennes permet de proposer des croisements futurs afin d’améliorer la génétique de la race si le besoin s’en fait. La parenté entre les individus est plus élevée que dans les autres races étudiées et l’étude des segments HBD et des ROH permet de visualiser que l’autozygotie a augmenté récemment, il y a 8 à 16 générations. Ces résultats coïncident avec l’étude du pedigree de la race par Meyermans et al., (2020) mettant en évidence une utilisation excessive de certains béliers depuis 2000. Ces résultats permettent de mettre en place des conseils d’élevage et de croisements des reproducteurs afin d’améliorer la diversité génétique ou d’au moins stabiliser les populations actuelles de mouton Laitier Belge. Les béliers reproducteurs devraient être utilisés à meilleur escient afin d’éviter la dépression de consanguinité et la fixation d’allèles délétères sur le long terme.