Contribution à l'étude des Escherichia coli résistants à la colistine dans la filière ovine

Abstract

L’antibiorésistance est l’un des problèmes majeurs du 21e siècle. Face à l’augmentation mondiale des pathogènes multirésistants, la colistine a été réintroduite comme traitement de dernier recours en médecine humaine pour les infections causées par des bactéries Gram négatives multirésistantes dont notamment Escherichia coli, responsable du plus grand nombre de décès humains attribuables à l’antibiorésistance en 2019. Tandis que la colistine avait longtemps été mise de côté en médecine humaine en raison de sa neuro- et néphrotoxicité par voie parentérale, elle a largement été utilisée depuis sa découverte en médecine vétérinaire pour la prévention ou le traitement oral des infections intestinales par des entérobactéries chez les animaux de rente. Alors que seule une résistance chromosomique à la colistine était autrefois rapportée, un intérêt mondial s’est porté sur cet antibiotique en raison de la découverte en 2015 d’un gène de résistance à support plasmidique, appelé mcr-1, et à l’heure actuelle, ce sont 10 variants qui ont été rapportés à travers le monde, laissant craindre une dissémination des résistances envers différents genres d’entérobactéries ainsi qu’un risque de transmission des résistances de l’animal à l’Homme. Ce travail a permis de mieux comprendre, à travers la revue de la littérature, le rôle des animaux de rente en tant que réservoir de la résistance à colistine à support plasmidique. Une partie expérimentale a apporté des données de prévalence d’Escherichia coli résistants à la colistine dans un élevage ovin wallon, espèce pour laquelle peu de données sont disponibles. Sur les 2 lots agneaux suivis longitudinalement durant leur période d’engraissement, aucun échantillon ne présentait d’E. coli résistants ayant concentration minimale inhibitrice >2 µg/ml. Ces résultats vont dans le sens de ce qui a été observé chez d’autres espèces au niveau national, la résistance à la colistine restant rare en Belgique. Néanmoins, le rôle du mouton en tant que réservoir de gènes mcr ne doit pas être négligé. Bien que les restrictions quant à l’usage de la colistine en médecine vétérinaire chez les animaux de rente aient permis une amélioration de la situation, avec une diminution du portage chez les animaux producteurs de denrées alimentaires d’E. coli résistants à la colistine et porteurs de mcr, les efforts quant à l’utilisation raisonnée des antimicrobiens et la surveillance des résistances en médecines humaine et vétérinaire dans une approche « One Health » doivent être maintenus et promus.