Bioremédiation de pesticide : détection de micro-organismes issus d'un biofiltre et évaluation de leur capacité de biodégradation de pesticides.

Abstract

La dégradation microbienne est considérée comme l’un des processus les plus importants dans le devenir des pesticides présents dans les sols. Cette biodégradation repose sur l’activité de microorganismes spécifiques capables de métaboliser ou transformer ces composés. Cependant, dans des conditions réelles de terrain, l’utilisation de ces microorganismes reste complexe à mettre en œuvre, car encore peu étudiée. Dans le cadre de ce travail, nous avons cherché à isoler et identifier des micro-organismes capables de dégrader le métamitron et le lénacil, deux herbicides couramment utilisés dans la culture de la betterave sucrière. Les souches ont été obtenues par cultures d’épuisement en milieu minimal, où le pesticide servait de seule source de carbone. Leurs capacités de dégradation ont ensuite été évaluées en conditions contrôlées, en milieu liquide minimal, avant de passer à la caractérisation cinétique des souches sélectionnées. Au total, 31 souches ont été isolées à partir de cinq sources environnementales. Parmi elles, trois souches (8M, 29M et 30M) ont montré une capacité à dégrader totalement le métamitron et ont été retenues pour une caractérisation complète. Aucune souche n’a été sélectionnée pour le lénacil, bien que certaines aient montré un potentiel partiel à explorer ultérieurement. Ce travail met en évidence, pour la première fois dans la littérature, une dégradation de plus de 90 % du métamitron en 24h par une souche de Rhodococcus. Ce résultat ouvre de nouvelles perspectives en matière de bioremédiation et constitue une première étape vers une meilleure compréhension des mécanismes microbiens impliqués dans la dégradation des herbicides, ainsi que vers le développement de solutions biologiques adaptées aux conditions réelles de terrain, telles que la bioaugmentation.