Quelle est l'influence des amorces PCR dans le diagnostic clinique de la salmonellose équine ? Comparaison de l'amorce de routine à une nouvelle amorce InvA dégénérée

Abstract

Dans la pratique de la médecine équine, principalement en clinique, la gestion des pathologies contagieuses, nosocomiales est particulièrement importante pour la protection des autres patients. Comme a pu le montrer l’épisode de salmonelles rapportées dans une clinique hongroise dans l’article de Katalin K-Jánosi et al., qui a abouti à l’euthanasie de 4 chevaux sur 5 atteints, une mauvaise gestion peut être dramatique. Dans ces infections nosocomiales, on retrouve certains virus (coronavirus chez les poulains, EHV…) mais aussi certaines bactéries comme les MRSA (MultiResistant Staphylococcus Aureus) ou Salmonella. Dans le cas des salmonelles, il existe de nombreux porteurs asymptomatiques qui peuvent atteindre 38,88% chez les jeunes chevaux (María Socorro Simó-Martínez & al.) qui peuvent excréter la bactérie de manière intermittente. Cette excrétion augmente chez les chevaux malades. Ainsi, la détection précoce d’un cheval atteint permet son isolement et réduit les risques de transmission. Parmi les méthodes de détection en complément de l’examen clinique (diarrhée, endotoxémie…), on peut trouver la culture bactérienne ou encore la PCR (Polymerase Chain Reaction). Chaque méthode présente des spécificités et sensibilité variables. La PCR est couramment utilisée pour la détection mais il existe de nombreuses variantes d’amorces qui ciblent différents gènes de la bactérie et qui peuvent influencer la sensibilité de la technique. Dans notre cas, le but est de mettre en évidence l’efficacité de détection d’une nouvelle amorce InvA dégénérée créé par le laboratoire de Pathologie de la faculté de Liège comparée à l’amorce STN, utilisée en routine par le laboratoire. Alors, ces résultats seront mis en relation entre eux et avec la culture bactérienne pour en extraire les avantages et inconvénients et aller vers une optimisation de la prise en charge des patients symptomatiques.