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Faculté de Psychologie, Logopédie et Sciences de l’Education
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MASTER THESIS
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Le taux de fausses découvertes dans la littérature sur la préférence de lieu conditionné induite par la nicotine chez la souris

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Léonard, François ULiège
Promotor(s) : Tirelli, Ezio ULiège
Date of defense : 31-Aug-2020/8-Sep-2020 • Permalink : http://hdl.handle.net/2268.2/10528
Details
Title : Le taux de fausses découvertes dans la littérature sur la préférence de lieu conditionné induite par la nicotine chez la souris
Author : Léonard, François ULiège
Date of defense  : 31-Aug-2020/8-Sep-2020
Advisor(s) : Tirelli, Ezio ULiège
Committee's member(s) : Quertemont, Etienne ULiège
Monseur, Christian ULiège
Language : French
Number of pages : 91
Keywords : [en] Mice
[en] Statistical power
[en] meta-research
[en] conditioned place preference
[en] nicotine
[en] FDR
[en] TRP
[en] false discovery rate
[en] true report probability
[fr] souris
[fr] puissance statistique
[fr] méta-recherche
[fr] préférence de lieu conditionné
[fr] nicotine
[fr] FDR
[fr] TRP
[fr] Taux de fausses découvertes
[fr] taux de vraies découvertes
Discipline(s) : Social & behavioral sciences, psychology > Animal psychology, ethology & psychobiology
Social & behavioral sciences, psychology > Neurosciences & behavior
Target public : Researchers
Professionals of domain
Student
Institution(s) : Université de Liège, Liège, Belgique
Degree: Master en sciences psychologiques, à finalité spécialisée en neuroscience cognitive et comportementale
Faculty: Master thesis of the Faculté de Psychologie, Logopédie et Sciences de l’Education

Abstract

[fr] Depuis quelques années un manque de puissance a été mis au jour dans divers domaines de recherche. Cela a abouti à de sérieux doutes quant à la reproductibilité de beaucoup de résultats scientifiques. À notre connaissance, aucune étude n’a évalué ce problème en psychopharmacologie expérimentale préclinique. Nous avons choisi d’étudier le sous-domaine de la préférence de lieu conditionné induite par la nicotine chez la souris (PLCNIC).
Nous avons identifié les articles le concernant sur PubMed et nous en avons extrait les tailles des échantillons, le type de tests statistiques (F ou t), leurs résultats, leurs degrés de liberté, et leurs p-valeurs. À partir de ces valeurs, nous avons calculé la puissance prospective médiane pour 6 tailles d’effets (classification de Sawilowsky, 2009). Le taux de vraies découvertes (True Report Probability : TRP) a été calculé à partir des puissances médianes, de l’erreur de type I fixée à 5 %, et de la plausibilité que nous avons fait varier de 0 à 1.
Des 139 articles trouvés sur PubMed, 48 ont rencontré nos critères d’inclusion. Ces 48 articles contenaient 109 tests statistiques utilisables pour notre projet. Dans cet échantillon de tests 77,57 % sont significatifs. Les puissances médianes pour les tests F pour les petites, moyennes, et grandes tailles d’effet sont respectivement de 9,5 %, 34,1 % et 70,4 %. Pour les tests t nous avons trouvé 6,8 %, 17 %, et 35,8 %. Aucun de ces chiffres n’atteint le seuil recommandé de 80 %. Pour une plausibilité de 10 %, nous trouvons des TRP pour les tests F pour une petite, moyenne et grande taille d’effet de 16 % 40,8 %, et 58,5 % soit des taux de fausses découvertes de 84 %, 59,2 %, et 41,5 %. Pour les tests t les TRP pour les mêmes tailles d’effets sont de 12 %, 25,3 %, et 41,7 % soit des taux de fausses découvertes de 88 %, 74,7 %, et 58,3 %, bien supérieurs aux 5 % maximum que l’on croit garantis par la probabilité alpha.
Nous retrouvons donc, dans le sous-domaine de la PLCNIC, le manque de puissance et l’augmentation de faux positif associée qui ont déjà été observés dans d’autres disciplines.
Nous avons aussi étendu les graphiques de Ioannidis (2005) pour représenter les TRP qu’on obtient avec des rapports de chance supérieurs à 1/1 qui pourrait donner des TRP plus favorables.


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Author

  • Léonard, François ULiège Université de Liège > Master sc. psycho., à fin.

Promotor(s)

Committee's member(s)

  • Quertemont, Etienne ULiège Université de Liège - ULiège > Département de Psychologie > Psychologie quantitative
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  • Monseur, Christian ULiège Université de Liège - ULiège > Département des Sciences de l'éducation > Psychométrie et édumétrie
    ORBi View his publications on ORBi
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