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Faculté de Médecine
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MASTER THESIS
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Thesis, COLLÉGIALITÉ

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Leclercq, Gérôme ULiège
Promotor(s) : Phillips, Christophe ULiège
Date of defense : 5-Jul-2023 • Permalink : http://hdl.handle.net/2268.2/17910
Details
Title : Thesis, COLLÉGIALITÉ
Translated title : [fr] Outil automatique de prétraitement des données acquises au Centre de Recherches du Cyclotron
Author : Leclercq, Gérôme ULiège
Date of defense  : 5-Jul-2023
Advisor(s) : Phillips, Christophe ULiège
Committee's member(s) : Vandewalle, Gilles ULiège
Poulet, Christophe ULiège
Degrave, François 
Language : English
Number of pages : 50
Keywords : [en] data management
[en] pipeline
[en] standardisation
[en] neuroimagery
[en] data pre-processing
Discipline(s) : Human health sciences > Radiology, nuclear medicine & imaging
Engineering, computing & technology > Multidisciplinary, general & others
Commentary : Le code source du prototype de pipeline est disponible dans les URL complémentaire
Research unit : GIGA-CRC
Target public : Researchers
Professionals of domain
Complementary URL : https://gitlab.uliege.be/CyclotronResearchCentre/LocalResources/acquisitionpipelinewg/crc_preprocessing_pipeline/-/tree/alpha_1.0?ref_type=tags
https://gitlab.uliege.be/CyclotronResearchCentre/LocalResources/acquisitionpipelinewg/cake_php_interface
Institution(s) : Université de Liège, Liège, Belgique
Degree: Master en sciences biomédicales, à finalité spécialisée en biomédical data management
Faculty: Master thesis of the Faculté de Médecine

Abstract

[en] Medical data management, particularly in the field of neuroimaging, is essential for neurological research. Technological advances have enabled the massive collection of complex and voluminous data in a multitude of formats. Effective management of this data is necessary to facilitate research in the case of this thesis, but also accurate diagnosis and personalised treatment if looking a little further afield. The aim of this thesis is to develop an automatic tool that addresses the challenges of collecting, storing, pre-processing and distributing data acquired in a neurology institution, specifically the Cyclotron Research Centre. To achieve these objectives, a prototype pipeline has been developed incorporating various stages of data processing treating MRI and Actigraphy imagery data.

[fr] La gestion des données médicales, en particulier dans le domaine de la neuro-imagerie, est essentielle pour la recherche neurologique. Les avancées technologiques ont permis la collecte massive de données complexes et volumineuses dans une multitude de formats. Une gestion efficace de ces données est nécessaire pour faciliter la recherche dans le cas de cette thèse, mais aussi dans le cas d'un diagnostic précis et d'un traitement personnalisé si l'on regarde un peu plus loin. L'objectif de cette thèse est de développer un outil automatique qui répond aux défis de la collecte, du stockage, du prétraitement et de la distribution des données acquises dans une institution de recherche en neurologie, plus précisément le Centre de Recherche du Cyclotron. Pour atteindre ces objectifs, un prototype de pipeline a été développé, intégrant différentes étapes de pré-traitement des données d'imagerie IRM et Actigraphie.


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Access thesis_Leclercq.pdf
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Size: 3.12 MB
Format: Adobe PDF

Author

  • Leclercq, Gérôme ULiège Université de Liège > Master sc. bioméd., à fin.

Promotor(s)

Committee's member(s)

  • Vandewalle, Gilles ULiège Université de Liège - ULiège > Département des sciences biomédicales et précliniques > Département des sciences biomédicales et précliniques
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  • Poulet, Christophe ULiège Centre Hospitalier Universitaire de Liège - CHU > Département de médecine interne > Service de rhumatologie
    ORBi View his publications on ORBi
  • Degrave, François
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