Thesis, COLLÉGIALITÉ
Leclercq, Gérôme
Promotor(s) : Phillips, Christophe
Date of defense : 5-Jul-2023 • Permalink : http://hdl.handle.net/2268.2/17910
Details
Title : | Thesis, COLLÉGIALITÉ |
Translated title : | [fr] Outil automatique de prétraitement des données acquises au Centre de Recherches du Cyclotron |
Author : | Leclercq, Gérôme |
Date of defense : | 5-Jul-2023 |
Advisor(s) : | Phillips, Christophe |
Committee's member(s) : | Vandewalle, Gilles
Poulet, Christophe Degrave, François |
Language : | English |
Number of pages : | 50 |
Keywords : | [en] data management [en] pipeline [en] standardisation [en] neuroimagery [en] data pre-processing |
Discipline(s) : | Human health sciences > Radiology, nuclear medicine & imaging Engineering, computing & technology > Multidisciplinary, general & others |
Commentary : | Le code source du prototype de pipeline est disponible dans les URL complémentaire |
Research unit : | GIGA-CRC |
Target public : | Researchers Professionals of domain |
Complementary URL : | https://gitlab.uliege.be/CyclotronResearchCentre/LocalResources/acquisitionpipelinewg/crc_preprocessing_pipeline/-/tree/alpha_1.0?ref_type=tags https://gitlab.uliege.be/CyclotronResearchCentre/LocalResources/acquisitionpipelinewg/cake_php_interface |
Institution(s) : | Université de Liège, Liège, Belgique |
Degree: | Master en sciences biomédicales, à finalité spécialisée en biomédical data management |
Faculty: | Master thesis of the Faculté de Médecine |
Abstract
[en] Medical data management, particularly in the field of neuroimaging, is essential for neurological research. Technological advances have enabled the massive collection of complex and voluminous data in a multitude of formats. Effective management of this data is necessary to facilitate research in the case of this thesis, but also accurate diagnosis and personalised treatment if looking a little further afield. The aim of this thesis is to develop an automatic tool that addresses the challenges of collecting, storing, pre-processing and distributing data acquired in a neurology institution, specifically the Cyclotron Research Centre. To achieve these objectives, a prototype pipeline has been developed incorporating various stages of data processing treating MRI and Actigraphy imagery data.
[fr] La gestion des données médicales, en particulier dans le domaine de la neuro-imagerie, est essentielle pour la recherche neurologique. Les avancées technologiques ont permis la collecte massive de données complexes et volumineuses dans une multitude de formats. Une gestion efficace de ces données est nécessaire pour faciliter la recherche dans le cas de cette thèse, mais aussi dans le cas d'un diagnostic précis et d'un traitement personnalisé si l'on regarde un peu plus loin. L'objectif de cette thèse est de développer un outil automatique qui répond aux défis de la collecte, du stockage, du prétraitement et de la distribution des données acquises dans une institution de recherche en neurologie, plus précisément le Centre de Recherche du Cyclotron. Pour atteindre ces objectifs, un prototype de pipeline a été développé, intégrant différentes étapes de pré-traitement des données d'imagerie IRM et Actigraphie.
Cite this master thesis
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