Typologie des échouages, causes de mortalité des pinnipèdes de 1995 à 2021 et étude sur Brucella spp. et Influenza en Belgique et au Nord de la France entre 2016 et 2023

Abstract

Depuis 1995, une augmentation significative des échouages de phoques gris (Halichoerus grypus) et de phoques communs (Phoca vitulina) a été observée dans la baie sud de la mer du Nord. L’objectif de ce travail consiste à mettre en évidence les principales lésions et les facteurs de mortalité prédominants chez les phoques communs et les phoques gris le long des côtes françaises et belge entre 1995 et 2021. Les autopsies et la collecte d'échantillons ont été réalisées selon un protocole standard. Les observations les plus fréquentes comprenaient: des congestions et oedème pulmonaire, des hématomes sous cutanés et intramusculaires, du parasitisme des voies respiratoires et de l'émaciation. Les principales causes de mortalité étaient d’origine traumatique (46%), avec un pic en avril, principalement dues aux captures accidentelles dans les filets de pêche (66.1%). Les processus infectieux (31%) sont représentés principalement par une pneumonie associée à une émaciation et une infestation parasitaire pulmonaire sévère. L'émaciation seule (12%) arrive en troisième position et apparaît comme une cause de mortalité émergente. L’augmentation des échouages observée depuis ces deux dernières décennies est principalement liée au retour des phoques en mer du Nord et est influencée par d’autres facteurs tels que les causes traumatiques d’origine anthropique. Ainsi, les impacts des activités humaines jouent un rôle majeur dans la mortalité observée dans notre large échantillon. Parallèlement, cette intensification croissante des activités anthropiques étroitement liée à la proximité des mammifères marins, ouvre la voie à des considérations substantielles concernant la possibilité de propagation de maladie zoonotique telle que la brucellose et la l’influenza. Ainsi pour évaluer cette incidence, nous avons analysé des échantillons de 14 phoques gris et 23 phoques communs échoués entre 2016 et 2023 sur les côtes nord françaises et belges à l'aide d’une qPCR et d’une RT-qPCR. Trois cas d'infection à Brucella spp. ont été confirmés, contrairement à l'influenza qui n’a présenté aucun cas positif. Ces résultats soulignent la nécessité de poursuivre les recherches sur les causes de mortalité chez les phoques et d’explorer davantage le potentiel zoonotique de ces deux zoonoses.