Impact des conditions nutritionnelles sur la quantité et sur la variété structurale et fonctionnelle des surfactines produites par Bacillus Amyloliquefaciens

Abstract

Le présent travail analyse l’impact des conditions nutritionnelles sur la production de surfactines par Bacillus amyloliquefaciens. Cette analyse se fait au travers de trois aspects : la diversité structurale des surfactines, la dynamique de production de celles-ci et leurs activités biologiques. Dans un premier temps, la comparaison de différents milieux de cultures a permis de sélectionner le milieu RE (« recomposed exudates ») comme milieu reproduisant suffisamment bien les conditions nutritionnelles de la rhizosphère. La diversité structurale a été analysée par UPLC-MS et a mis en évidence, en comparaison au milieu riche LB, la production supplémentaire de trois variants de surfactine lorsque B. amyloliquefaciens est cultivé en milieu RE. Des analyses UPLC-MS et une RT-qPCR ont permis de comparer la quantité de surfactines et l’expression des gènes associés à la biosynthèse de celles-ci en milieu RE et en milieu LB. L’activité biologique des surfactines produites en milieu RE a été évaluée via deux expérimentations : un test d’antagonisme sur deux phytopathogènes bactériens et un test ROS (« reactive oxygen species ») permettant d’estimer le pouvoir éliciteur des surfactines.