Master Thesis Online
Data-driven Inference of a TF-regulated Metabolic Network for photosynthetic organism modelling: Chlamydomonas Reinhardtii.
Waterplas, Dries 
Promoteur(s) :
Meyer, Patrick
Date de soutenance : 7-sep-2018 • URL permanente : http://hdl.handle.net/2268.2/5438
Mémoire2018_WD_ABSTR_N_ABBREV.pdfDétails
| Titre : | Data-driven Inference of a TF-regulated Metabolic Network for photosynthetic organism modelling: Chlamydomonas Reinhardtii. |
| Titre traduit : | [fr] Inférence d'un réseau métaboliques sous régulation de TF pour la modélisation d'organismes photosynthétiques: Chlamydomoans Reinhardtii |
| Auteur : | Waterplas, Dries
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| Date de soutenance : | 7-sep-2018 |
| Promoteur(s) : | Meyer, Patrick
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| Membre(s) du jury : | Baurain, Denis
Farnir, Frédéric
Cardol, Pierre
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| Langue : | Anglais |
| Nombre de pages : | 74 |
| Mots-clés : | [fr] Chlamydomonas Reinhardtii Metabolic Network Constraint-Based Modelling Transcriptomic Regulation |
| Discipline(s) : | Sciences du vivant > Biochimie, biophysique & biologie moléculaire |
| Centre(s) de recherche : | BioSys : Bioinformatics and Systems Biology Lab |
| Intitulé du projet de recherche : | Improving metabolic models of photosynthetic organisms using regulation from TRN-Inference |
| Public cible : | Chercheurs Professionnels du domaine Etudiants |
| Institution(s) : | Université de Liège, Liège, Belgique |
| Diplôme : | Master en biochimie et biologie moléculaire et cellulaire, à finalité spécialisée en bioinformatique et modélisation |
| Faculté : | Mémoires de la Faculté des Sciences |
Résumé
[fr] Metabolic pathways involved in photosynthesis and biosynthesis of lipids, hydrogen or growth are typically regulated by complex interdependent mechanisms involving multiple fronts of omics (genomics, transcriptomics, proteomics, …). Here, we apply Constraint-Based Modelling (CBM) techniques on a genome-scale metabolic network reconstruction of C. reinhardtii, and improve the model by integrating constraints from a Transcriptional Regulation Network, thus taking into account cell gene expression shifts under envrionmental changes.
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Mémoire2018_Waterplas_Dries.pdf
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L'Université de Liège ne garantit pas la qualité scientifique de ces travaux d'étudiants ni l'exactitude de l'ensemble des informations qu'ils contiennent.
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