Construction et caractérisation d'hydrolases de peptidoglycane (lysines) avec de nouvelles propriétés

Abstract

Au vu de l’émergence des nombreuses résistances bactériennes aux antibiotiques et les complications engendrées par ces bactéries, la recherche d’alternatives à ces molécules est inévitable. Plusieurs centres de recherche se sont intéressés aux enzymes qui dégradent le peptidoglycane (appelé lysines) et provoquent la lyse des cellules bactériennes. Certaines de ces études ont démontré que ces protéines empêchaient des septicémies chez des souris infectées ou permettaient de soigner des infections bactériennes cutanées lors de leur application locale sur la zone infectées (Rodríguez-Rubio, et al., 2013), d’où l’intérêt important qui s’est porté vers ces lysines. Il serait intéressant de pouvoir modulé leur action et leur reconnaissance pour les bactéries. Ce projet vise à réaliser une collection de domaine catalytique de ces lysines et des domaines de liaisons au peptidoglycane. Le but serait alors de pouvoir coupler n’importe quel domaine catalytique avec un domaine de liaison choisit afin d’augmenter la spécificité et l’efficacité des enzymes pour une souche bactérienne en particulier. Pour cela, les domaines catalytiques et de domaines de liaisons au PG vont être couplé à des peptides capables de s’apparier entre eux (SYNZIPs) (Thompson, et al., 2012). Mon travail de mémoire a eu pour but de réaliser les constructions de différents domaines catalytiques (CHAP, M23, Lysozyme λ) et domaines de liaisons au PG (SH3b, AMIN, SPOR) et de tester leur production. Des tests de purification ont été réalisé de même que des essaies de co-élutions d’un domaine catalytique avec un domaine de liaison afin de s’assurer du bon appariement des peptides SYNZIPs. Après réalisation des co-élutions, un premier test d’activité des protéines a permis de s’assurer de l’activité de notre protéine chimère.