Master Thesis Online
Thesis, COLLÉGIALITÉ
Demuynck, Emmanuel 
Promoteur(s) :
Poulet, Christophe
Date de soutenance : 6-sep-2022 • URL permanente : http://hdl.handle.net/2268.2/15934
Détails
| Titre : | Thesis, COLLÉGIALITÉ |
| Titre traduit : | [fr] Influence de la variation du data background dans les analyses d’enrichissement de voies de signalisation biologiques par l’algorithme GSEA |
| Auteur : | Demuynck, Emmanuel
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| Date de soutenance : | 6-sep-2022 |
| Promoteur(s) : | Poulet, Christophe
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| Membre(s) du jury : | Lavergne, Arnaud
Charloteaux, Benoit Kolh, Philippe |
| Langue : | Français |
| Nombre de pages : | 53 |
| Mots-clés : | [en] RNA-seq, NGS, GSEA, DESeq2, bioinformatics, biostatistics |
| Discipline(s) : | Sciences de la santé humaine > Médecine de laboratoire & technologie médicale |
| Centre(s) de recherche : | GIGA |
| Public cible : | Chercheurs Professionnels du domaine Etudiants |
| Institution(s) : | Université de Liège, Liège, Belgique |
| Diplôme : | Master en sciences biomédicales, à finalité spécialisée en biomédical data management |
| Faculté : | Mémoires de la Faculté de Médecine |
Résumé
[fr] La recherche d’information biologiquement pertinente à partir de données « omics » est un défi majeur dans les analyses d’expression à l’échelle du génome. Les données « omics » ne génèrent pas toutes la même quantité de variables. Cependant, les algorithmes de détection de voies de signalisation sont utilisés uniformément. La question de la relevance des voies de signalisation détectées avec des jeux de données moins denses en information peut donc se poser. Dans cette étude, nous évaluons comment la variation de la quantité de data background dans un jeu de données transcriptomiques influe sur les résultats générés par GSEA, l’algorithme le plus communément utilisé par la communauté scientifique pour la recherche de voies de signalisation biologiques.
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EMMANUEL_DEMUYNCK_memoire_version_finale.pdf
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