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Thesis, COLLÉGIALITÉ

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Demuynck, Emmanuel ULiège
Promoteur(s) : Poulet, Christophe ULiège
Date de soutenance : 6-sep-2022 • URL permanente : http://hdl.handle.net/2268.2/15934
Détails
Titre : Thesis, COLLÉGIALITÉ
Titre traduit : [fr] Influence de la variation du data background dans les analyses d’enrichissement de voies de signalisation biologiques par l’algorithme GSEA
Auteur : Demuynck, Emmanuel ULiège
Date de soutenance  : 6-sep-2022
Promoteur(s) : Poulet, Christophe ULiège
Membre(s) du jury : Lavergne, Arnaud 
Charloteaux, Benoit 
Kolh, Philippe 
Langue : Français
Nombre de pages : 53
Mots-clés : [en] RNA-seq, NGS, GSEA, DESeq2, bioinformatics, biostatistics
Discipline(s) : Sciences de la santé humaine > Médecine de laboratoire & technologie médicale
Centre(s) de recherche : GIGA
Public cible : Chercheurs
Professionnels du domaine
Etudiants
Institution(s) : Université de Liège, Liège, Belgique
Diplôme : Master en sciences biomédicales, à finalité spécialisée en biomédical data management
Faculté : Mémoires de la Faculté de Médecine

Résumé

[fr] La recherche d’information biologiquement pertinente à partir de données « omics » est un défi majeur dans les analyses d’expression à l’échelle du génome. Les données « omics » ne génèrent pas toutes la même quantité de variables. Cependant, les algorithmes de détection de voies de signalisation sont utilisés uniformément. La question de la relevance des voies de signalisation détectées avec des jeux de données moins denses en information peut donc se poser. Dans cette étude, nous évaluons comment la variation de la quantité de data background dans un jeu de données transcriptomiques influe sur les résultats générés par GSEA, l’algorithme le plus communément utilisé par la communauté scientifique pour la recherche de voies de signalisation biologiques.


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Document(s)

File
Access EMMANUEL_DEMUYNCK_memoire_version_finale.pdf
Description:
Taille: 4.75 MB
Format: Adobe PDF

Auteur

  • Demuynck, Emmanuel ULiège Université de Liège > Master sc. bioméd., à fin.

Promoteur(s)

Membre(s) du jury

  • Lavergne, Arnaud
  • Charloteaux, Benoit
  • Kolh, Philippe
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