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MASTER THESIS
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Development and Characterization of Recombinant Adeno-Associated Virus Displaying mCherry Proteins at their Surface

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Clette, Benoit ULiège
Promotor(s) : Di Valentin, Emmanuel ULiège ; Neirinckx, Virginie ULiège
Date of defense : 26-Jun-2024 • Permalink : http://hdl.handle.net/2268.2/20544
Details
Title : Development and Characterization of Recombinant Adeno-Associated Virus Displaying mCherry Proteins at their Surface
Translated title : [fr] Développement et caractérisation de virus adéno-associés recombinants exposant des protéines mCherry à leur surface
Author : Clette, Benoit ULiège
Date of defense  : 26-Jun-2024
Advisor(s) : Di Valentin, Emmanuel ULiège
Neirinckx, Virginie ULiège
Committee's member(s) : Sadzot, Catherine ULiège
Dumoulin, Mireille ULiège
Legrand, Sylvie ULiège
Language : English
Number of pages : 62
Discipline(s) : Life sciences > Biochemistry, biophysics & molecular biology
Commentary : CONFIDENTIEL
Funders : Viral Vector Platform
Research unit : GIGA
Name of the research project : Development and Characterization of Recombinant Adeno-Associated Virus Displaying mCherry Proteins at their Surface
Institution(s) : Université de Liège, Liège, Belgique
Degree: Master en biochimie et biologie moléculaire et cellulaire, à finalité approfondie
Faculty: Master thesis of the Faculté des Sciences

Abstract

[fr] Le ciblage spécifique des AAV vers un type cellulaire d'intérêt peut ne pas être réalisable avec les
sérotypes naturels d'AAV. L'utilisation de nanocorps (nb) couplés aux AAV représente une technologie
de choix pour surmonter ces obstacles, permettant de moduler plus facilement le tropisme des AAV avec
une grande efficacité, et de développer des thérapies géniques et cellulaires plus efficaces et plus sûres.
Ce ciblage optimisé permet de réduire les effets indésirables liés à la transduction d'autres cellules que
les cellules cibles.
Dans le cadre de notre recherche, nous avons développé et caractérisé des vecteurs viraux recombinants
basés sur les virus adéno-associé (rAAV) qui présentent des protéines mCherry à la surface de leur
capside, avec pour objectif final de remplacer cette protéine fluorescente par un nanobody possédant
une affinité spécifique envers différents récepteurs cellulaires, ce qui pourrait ainsi permettre de rediriger
les rAAV de manière efficace. En nous basant sur divers résultats et informations obtenus dans la
littérature, nous avons réussi à muter des résidus spécifiques de la capside des rAAV impliqués dans la
liaison avec leur récepteur naturel, le protéoglycane sulfate d’héparane (HSPG).
En utilisant un phénotypage de cellules transduites avec nos vecteurs modifiés grâce à la cytométrie en
flux, nous avons confirmé que ces vecteurs rAAV-mCherry montrent une efficacité de transduction
réduite dans les cellules de glioblastome et les cellules LX-1B4, par rapport aux vecteurs rAAV de
sérotype 2. Pour augmenter encore la spécificité et l'efficacité de nos vecteurs, nous avons tenté de cloner
des séquences de nanobodies dans le gène de la capside. Malgré les obstacles rencontrés nous lors de
nos premiers essais de clonage, nous continuons à travailler sur l'établissement d'une méthode robuste
et reproductible pour incorporer les séquences de nanobodies dans le gène codant pour les protéines de
la capside des AAV.


File(s)

Document(s)

File
Access Mémoire Benoit Clette BBMC 2023-2024, Viral vector platform (ok).pdf
Description:
Size: 3.3 MB
Format: Adobe PDF

Author

  • Clette, Benoit ULiège Université de Liège > Master bioch. & biol. mol. , fin. approf.

Promotor(s)

Committee's member(s)

  • Sadzot, Catherine ULiège Université de Liège - ULiège > Département des sciences de la vie > Virologie - Immunologie
    ORBi View his publications on ORBi
  • Dumoulin, Mireille ULiège Université de Liège - ULiège > Département des sciences de la vie > Centre d'Ingénierie des Protéines (CIP)
    ORBi View his publications on ORBi
  • Legrand, Sylvie ULiège Université de Liège - ULiège > Département des sciences de la vie > Département des sciences de la vie
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